no.1592-1 : 「今年はコレージュ修了証書に変更なし」
Toutes les matières de 3e devaient être prises en compte dans les 40 % de contrôle continu, avec une « moyenne des moyennes ». (中学4年次の全科目が40%を占める小テストにカウントされ、<平均点の平均点>を元に計算される予定だった。)
devaient と半過去形です。「…されるはずだった(が、されなかった)」という実行されるはずだったがそうはならなかったことを表します。
prendre en compte 「考慮する、計算にいれる」と意味です。ここでは受け身なので「考慮される、計算される」となります。
moyenne des moyennes は詳しくはわかりませんが、おそらく各教科の平均を出して、さらにそれぞれを出す、ということだと思います。